UPA Laboratorium Terpadu yang dahulunya bernama Laboratorium Dasar mulai dioperasikan sejak tahun 2015. Saat berstatus laboratorium Dasar, UPA Laboratorium Terpadu merupakan tempat pengadaan kegiatan-kegiatan pembelajaran mata kuliah dasar seperti keagamaan, penjasorkes, praktikum kimia dasar, fisika dsar, dan praktikum lain untuk seluruh jurusan di lingkungan UPN Veteran Yogyakarta. Pendirian Laboratorium Dasar pertama digagas oleh Ir. Sri Suhendri salah seorang Dosen Teknik Kimia UPN Veteran Yogyakarta.

Saat ini UPA Laboratorium Terpadu UPN Veteran Yogyakarta merupakan Laboratorium Tipe IV yang terdapat di pusat studi fakultas atau unit pelaksana teknis yang menyelenggarakan pendidikan dan/atau pelatihan dengan fasilitas penunjang peralatan katagori 1, 2, dan 3 dan bahan yang dikelola adalah bahan katagori umum dan khusus untuk melayani kegiatan penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat, mahasiswa dan dosen.

UPA Laboratorium Terpadu melayani jasa pengujian bagi :

1. Mahasiswa Tugas Akhir S1, S2, dan S3
2. Penelitian Internal dan Eksternal
3. Perusahaan
   • Perusahaan bidang Migas dan Energi
   • Perusahaan bidang Mineral dan Batubara
   • Industri Kimia
   • Industri Pangan

Adapun estafet kepemimpinan di Laboratorium Terpadu ini antara lain sebagai berikut :

1. Ir. Sri Suhenry (1991 – 1998)
2. Ir. Harso  Pawignyo, M.T. (1998 – 2006)
3. Ir. M. Syahri, M.T. Ph.D (2006 – 2014)
4. Dr. Adi Ilcham, M.T. (2014 – 2017)
5. Dr. Ir. Ramli Sitanggang, M.T.  (2017 – 2021)
6. Dr. Ir. Joko Soesilo, M.T., IPM (2021 – 2025)
7. Dr. Eng. Ir. Yulius Deddy Hermawan, S.T., M.T (2025 – sekarang)